Human Proteome Project (HPP): plaan, mis hõlmab 90.4% vabastatud inimproteoomist

Inimene Proteome Project (HPP) käivitati 2010. aastal pärast projekti edukat lõpetamist Inimene Genoomiprojekt (HGP) tuvastamiseks, iseloomustamiseks ja kaardistamiseks inim- proteoom (kogu valkude komplekti, mida ekspresseerib inim- genoom). Oma kümnendal aastapäeval on HPP välja andnud esimese väga range kavandi, mis hõlmab 90.4% inim- proteoom. Elu koodina on sellel verstapostil väga oluline mõju inim- tervis ja teraapiad.   

Lõpetatud 2003is Inimene Genome Project (HGP) oli 1990. aastal loodud rahvusvaheline koostöö, mille eesmärk oli tuvastada kogu inim- geenid ja määrata DNA aluste täielik järjestus inim- genoom. 15. jaanuaril 2001 avaldas HGP esialgse järjestuse ja analüüsi inim- genoom. Identifitseerimine, iseloomustamine ja kaardistamine inim- proteoom (kogu genoomi poolt kodeeritud valkude komplement) oli järgmine loogiline samm. Seetõttu Inimene Proteome Organisatsioon (HUPO) moodustati 9. veebruaril 2001, et edendada proteoomikauuringuid. 23. septembril 2010 käivitati HUPO ametlikult Inimene Proteome Project (HPP), mille eesmärk on koostada projekti plaan inim- proteoom ⁽¹⁾.  

Programmi analüüs inim- genoomi ennustab umbes 20,300 XNUMX valku kodeerivat geeni. Kogu nende geenide poolt kodeeritud valkude komplekt moodustabinim- proteoom'. Inimene proteoom on palju suurem kui "inimese genoom", kuna ühte geeni saab ekspresseerida erinevates vormides (proteovormides) keemiliste modifikatsioonide tulemusena translatsiooni ajal ja pärast seda. Arvatakse, et ühes indiviidis võib koos eksisteerida miljon proteovormi. 2010. aastal tuvastati HPP alguses vaevalt 70% genoomianalüüsiga ennustatud valkudest. Proteoomiprojekti eesmärk oli täita see teadmistelünk. Tehnoloogia arenguga on muutunud võimalikuks valke ja nende vorme suurema täpsusega tuvastada ja kvantifitseerida. Siiski on palju puuduvaid valke (valgud genoomianalüüsiga ennustatud, kuid siiski avastamata) ^(2,3). Projekt on veel pooleli; verstapost on siiski saavutatud. 

16. oktoobril 2020, oma kümnendal aastapäeval, avaldas HPP esimese ülimalt range kavandi, mis katab 90.4% inimese proteoomist ⁽¹⁾. See parandab märkimisväärselt meie teadmisi inimese bioloogiast ja arusaamist molekulaarsetest mehhanismidest raku- ja molekulaarsel tasandil, eriti rollist, mida mängib inimese proteoom, mis viib otseselt vähi, südame-veresoonkonna ja nakkushaiguste diagnostika- ja ravimeetodite uurimis- ja arendustegevusse, eriti isikupärastatud ja täppismeditsiin ⁽⁴⁾. 

Inimese areng Valk Atlas kujutab endast väga olulist edusamme edasistes uuringutes inimese diagnostika ja ravi valdkonnas ^(5,6).  

***

viited:

1. HUPO 2021. Proteoomika ajaskaala. Saadaval https://hupo.org/Proteomics-Timeline.  

2. neXtProt 2021. Inimese proteoom. Internetis saadaval aadressil https://www.nextprot.org/about/human-proteome Juurdepääs 30. detsembril 2020. 

3. Inserm, 2020. Proteoomika: elukood, mis on tõlgitud üle 90%. Postitatud 07. detsembril 2020. Veebis saadaval aadressil https://www.inserm.fr/actualites-et-evenements/actualites/proteomique-code-vie-traduit-plus-90 Juurdepääs 30. detsembril 2020.  

4. Adhikari, S., Nice, EC, Deutsch, EW et al. 2020. Inimese proteoomi ülimalt range plaan. Avaldatud: 16. oktoober 2020. Loodusteade 11, 5301 (2020). DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-020-19045-9  

5. Digre A. ja Lindskog C., 2020. Inimese valgu atlas – inimese proteoomi ruumiline lokaliseerimine tervises ja haigustes. Protein Science, 30. köide, 1. väljaanne. Esmakordselt avaldatud: 04. november 2020. DOI: https://doi.org/10.1002/pro.3987  

6. The Human Protein Atlas 2020. Human Protein Atlas Saadaval veebis aadressil https://www.proteinatlas.org/about Juurdepääs 30. detsembril 2020. 

***