Koronaviirused on RNA viirused kuulub coronaviridae perekonda. Need viirused näitavad replikatsiooni ajal märkimisväärselt kõrget vigade määra, kuna nende polümeraaside korrektuuri nukleaasi aktiivsus puudub. Teistes organismides parandatakse replikatsioonivead, kuid koroonaviirustel puudub see võime. Selle tulemusena jäävad koroonaviiruste replikatsioonivead parandamata ja kuhjuvad, mis omakorda toimivad nendes viirustes varieerumise ja kohanemise allikana. viirused. Seega on alati olnud omane, et koroonaviiruste genoomid mutatsioonid läbivad väga suure kiirusega; Mida rohkem edastatakse, seda rohkem juhtub replikatsioonivigu ja seega rohkem mutatsioone genoomis, mis põhjustab rohkem variandid järelikult.
Ilmselgelt uue vastu vahetamine variandid pole uus koroonaviirused. Inimlik koroonaviirused on lähiajaloos loonud mutatsioone uuteks vormideks. Neid oli mitu variandid vastutav erinevate epideemiate eest alates 1966. aastast, mil salvestati esimene episood.
SARS-CoV oli esimene surmav variant, mis põhjustas koronaviirus epideemia Hiinas Guangdongi provintsis 2002. aastal. MERS-CoV oli järgmine oluline variant, mis põhjustas 2012. aastal epideemia Saudi Araabias.
Romaan koronaviirus SARS-CoV-2, variant, mis vastutab praeguse COVID-19 pandeemia eest, mis algas 2019. aasta detsembris Hiinas Wuhanis ja levis seejärel kogu maailmas, et saada esimeseks koronaviirus pandeemia inimkonna ajaloos, on pidevalt läbi teinud edasist kohanemist, mis kuhjuvad erinevates geograafilistes piirkondades mutatsioone, mis on põhjustanud mitmeid alamaidvariandid. Need alam-variandid neil on väikesed erinevused nende genoomis ja spike-valkudes ning nende ülekandekiiruses, virulentsuses ja immuunsüsteemi nakkavuses.
Nende alamvariantide ohu alusel rühmitatakse need kolme kategooriasse – variante murettekitav (VOC), huvipakkuvad variandid või uuritavad variandid (VOI) ja variandid jälgimisel. See alamvariantide rühmitus põhineb tõenditel, mis on seotud nakkuse edasikanduvuse, immuunsuse ja raskusastmega.
- Murettekitavad variandid (LOÜ)
Murettekitavatel variantidel (LOÜ) on selge seos mis tahes rahvatervise meetmete (nt praegu kasutatavate vaktsiinide) ülekanduvuse või virulentsuse suurenemise või tõhususe vähenemisega.
| WHO märgis | Suguvõsad | Esmakordselt tuvastatud riik (kogukond) | Esmakordselt tuvastatud aasta ja kuu |
| Alfa | B.1.1.7 | Ühendkuningriik | september 2020 |
| beeta | B.1.351 | Lõuna-Aafrika | september 2020 |
| Gamma | P.1 | Brasiilia | detsember 2020 |
| Delta | B.1.617.2 | India | detsember 2020 |
- Huvipakkuvad variandid või uuritavad variandid (VOI)
Huvipakkuvatel või uuritavatel variantidel (VOI) on teadaolevalt geneetilised muutused, mis võivad mõjutada selle edasikandumist, virulentsust või rahvatervise meetmete tõhusust, ning on kindlaks tehtud, et need põhjustavad olulist levikut kogukonnas.
| WHO märgis | Suguvõsad | Esmakordselt tuvastatud riik (kogukond) | Esmakordselt tuvastatud aasta ja kuu |
| Eta | B.1.525 | Nigeeria | detsember 2020 |
| Iota | B.1.526 | USA | november 2020 |
| Kappa | B.1.617.1 | India | detsember 2020 |
| Lambda | C.37 | Peruu | detsember 2020 |
- Variandid seire all
Seire all olevad variandid tuvastatakse signaalidena ja on märke, et neil võivad olla lenduvate orgaaniliste ühenditega sarnased omadused, kuid tõendid võivad olla nõrgad. Seetõttu jälgitakse neid variante pidevalt muudatuste suhtes.
| WHO märgis | Suguvõsad | Esmakordselt tuvastatud riik (kogukond) | Esmakordselt tuvastatud aasta ja kuu |
| B.1.617.3 | India | veebruar 2021 | |
| A.23.1+E484K | Ühendkuningriik | detsember 2020 | |
| Lambda | C.37 | Peruu | detsember 2020 |
| B.1.351+P384L | Lõuna-Aafrika | detsember 2020 | |
| B.1.1.7+L452R | Ühendkuningriik | jaanuar 2021 | |
| B.1.1.7+S494P | Ühendkuningriik | jaanuar 2021 | |
| C.36+L452R | Egiptus | detsember 2020 | |
| AT.1 | Venemaa | jaanuar 2021 | |
| Iota | B.1.526 | USA | detsember 2020 |
| Zeta | P.2 | Brasiilia | jaanuar 2021 |
| AV.1 | Ühendkuningriik | märtsil 2021 | |
| P.1+P681H | Itaalia | veebruar 2021 | |
| B.1.671.2 + K417N | Ühendkuningriik | juuni 2021 |
See rühmitus on dünaamiline, mis tähendab, et alamvariandid võidakse ühest rühmast eemaldada või mis tahes rühma kaasata, olenevalt ohtude hindamise muutumisest edasikanduvuse, immuunsuse ja nakkuse tõsiduse osas.
Irooniline on see, et SAR-CoV-2 areng näib praegu jätkuvat. Lähtudes selle olemusest viirus, nii kaua kuni inimeste vahel levib, esineb replikatsioonivigu ja mutatsioone. Mõni mutant või variant võib ületada valikusurve muutuda nakkavamaks ja virulentsemaks või pääseda immuunvastusest, et muuta vaktsiin vähem efektiivseks. Tõenäoliselt tuvastatakse õigeaegselt palju rohkem variante kõrgema ülekandega piirkondades. Edastamise minimeerimine ja pidev jälgimine on ohjeldamise strateegiate võtmeks.
***
Allikad:
- Prasad U., 2021. SARS-CoV-2 uued tüved (the viirus COVID-19 eest vastutav): kas "neutraliseerivate antikehade" lähenemisviis võib olla vastus kiirele mutatsioonile? Teaduslik eurooplane. Postitatud 23. detsembril 2020. Veebis saadaval aadressil http://scientificeuropean.co.uk/medicine/new-strains-of-sars-cov-2-the-virus-responsible-for-covid-19-could-neutralising-antibodies-approach-be-answer-to-rapid-mutation/
- WHO, 2021. SARS-CoV-2 variantide jälgimine. Internetis saadaval aadressil https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/
- ECDPC 2021. SARS-CoV-2 murettekitavad variandid seisuga 8. juuli 2021. Veebis saadaval aadressil https://www.ecdc.europa.eu/en/covid-19/variants-concern
***
