Pidevalt muutuv keskkond põhjustab muutunud keskkonnas ellujäämiseks sobimatute loomade väljasuremise ja soodustab kõige paremate ellujäämist, mis kulmineerub uue liigi evolutsiooniga. Kuid tülatsiin (üldtuntud kui Tasmaania tiiger või Tasmaania hunt), Austraalia põlisrahvastest marsupial lihasööjast imetaja, mis suri välja umbes sajand tagasi, mitte aga loodusliku protsessi tõttu. orgaaniline evolutsiooni käigus, kuid inimmõjul võib see välja surra ja umbes kümne aasta pärast uuesti elada. Viimane elusolev tülatsiin suri 1936. aastal, kuid õnneks leiti muuseumidest sobivalt säilitatuna palju embrüoid ja noori isendeid. Tülatsiini genoomi on juba edukalt sekveneeritud, kasutades Austraalias Victoria muuseumis säilitatud 108-aastasest isendist ekstraheeritud tülatsiini DNA-d. Uurimisrühm tegi hiljuti koostööd biotehnoloogiaettevõttega, et kiirendada ülestõusmispüüdlusi.
Melbourne'i ülikooli tülatsiini integreeritud genoomi taastamise uuringute (TIGRR) labor on teinud koostööd Kolossaalsed bioteadused, geenitehnoloogia ettevõte, mis kiirendab jõupingutusi Tasmaania tiigri ellu äratamiseks (Thylacinus cynocephalus). Kokkuleppe kohaselt keskendub ülikooli TIGRR Lab Austraalia kukkurloomadele kohandatud paljunemistehnoloogiate loomisele, nagu IVF ja tiinus ilma surrogaadita. Kolossaalsed bioteadused pakuvad tülatsiini DNA reprodutseerimiseks oma CRISPR-i geenide redigeerimise ja arvutusbioloogia ressursse.
Tülatsiin (Thylacinus cynocephalus) on väljasurnud lihatoiduline marsupial imetaja, kes oli pärit Austraaliast. See oli tuntud kui Tasmaania tiiger, kuna tal oli alaselja. Sellel oli koerasarnane välimus, seetõttu tunti teda ka Tasmaania hundi nime all.
See kadus Austraalia mandrilt umbes 3000 aastat tagasi inimeste jahipidamise ja dingodega võistlemise tõttu, kuid populatsioon kasvas Tasmaania saarel õitsele. Nende arv Tasmaanias hakkas kahanema Euroopa asunike saabumisega, kes kiusasid neid süstemaatiliselt taga kariloomade tapmises kahtlustatuna. Selle tulemusena suri tülatsiin välja. Viimane tülatsiin suri vangistuses 1936. aastal.
Erinevalt paljudest väljasurnud loomadest, näiteks dinosaurustest, ei surnud tülatsiin välja loodusliku protsessi tõttu. orgaaniline evolutsioon ja looduslik valik. Nende väljasuremine oli inimeste põhjustatud, otsene lähimineviku inimeste küttimise ja tapmise tagajärg. Tülatsiin oli kohalikus toiduahelas tippkiskja, kes vastutas seega ökosüsteemi stabiliseerimise eest. Samuti on Tasmaania elupaik suhteliselt muutumatu, kuna tülatsiin suri välja, nii et pärast uuesti kasutuselevõttu võivad nad oma niši hõlpsalt uuesti hõivata. Kõik need tegurid muudavad tülatsiini sobivaks kandidaadiks väljasuremiseks või ülestõusmiseks.
Genoomi sekveneerimine on esimene ja äärmiselt oluline samm väljasuremispüüdlustes. Viimane tülatsiin suri 1936. aastal, kuid palju embrüoid ja noori isendeid leiti muuseumidest sobival kandjal säilitatuna. TIGRR Lab suutis Austraalias Victoria muuseumis säilitatud 108-aastasest isendist eraldada tülatsiini DNA. Seda ekstraheeritud DNA-d kasutades sekveneeriti tülatsiini genoom 2018. aastal ja värskendati 2022. aastal.
Tülatsiini järjestamine genoomi järgneb dunnarti genoomi sekveneerimine ja erinevuste tuvastamine. Dunnart on sugukonda dasyuridae kuuluva tülatsiini lähedane geneetiline sugulane, kelle munatuum tülatsiinitaolisest rakust kandub üle.
Järgmine samm on "tülatsiinilaadse raku" loomine. Abiga CRISPR ja muud geenitehnoloogia tehnoloogiad, tülatsiini geenid sisestatakse Dasyurid genoomi. Sellele järgneb tülatsiinitaolise raku tuuma ülekandmine nukleaarse Dasyuridi munaraku kasutades somaatilist rakku tuumaülekanne (SCNT) tehnoloogia. Ülekantud tuumaga muna toimib sügootina ja kasvab embrüoks. Embrüonaalset kasvu soodustatakse in vitro, kuni see on valmis surrogaadile ülekandmiseks. Arenenud embrüo siirdatakse seejärel surrogaadile, millele järgneb standardsed tiinuse, küpsemise ja sünni etapid.
Vaatamata märkimisväärsetele edusammudele geenitehnoloogia ja paljunemistehnoloogia vallas, on väljasurnud looma ülestõusmine endiselt peaaegu võimatu väljakutse. Paljud asjad pooldavad tülatsiini väljasuremise projekti; võib-olla kõige olulisem tegur on tülatsiini DNA edukas ekstraheerimine säilinud muuseumiproovist. Puhkus on tehnoloogia. Selliste loomade puhul nagu dinosaurused on väljasuremine võimatu lihtne, kuna pole võimalik eraldada kasulikku dinosauruse DNA-d dinosari genoomi järjestamiseks.
***
Allikad:
- Melbourne'i ülikool 2022. Uudised – labor teeb tohutu hüppe tülatsiini väljasuremise suunas Colossaalse geenitehnoloogia partnerluse abil. Postitatud 16. augustil 2022. Saadaval aadressil https://www.unimelb.edu.au/newsroom/news/2022/august/lab-takes-giant-leap-toward-thylacine-de-extinction-with-colossal-genetic-engineering-technology-partnership2
- Tülatsiini integreeritud genoomi taastamise uurimislabor (TIGRR Lab) https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/the-thylacine/ & https://tigrrlab.science.unimelb.edu.au/research/
- Tüülatsiin https://colossal.com/thylacine/
***
, a marsupial carnivore mammal indigenous to Australia that became extinct about a century ago, not due to natural process of organic evolution, but due to human influence may become de-extinct and live again in about a decade time. Last living thylacine died in 1936 but luckily, many embryos and young specimens were found suitably preserved in the museums. Thylacine genome has already been successfully sequenced using thylacine DNA extracted from 108-year-old specimen preserved at the Victoria Museum in Australia. The research team has recently tied up with a biotech firm to accelerate the efforts of resurrection.){kind=link}